S'inicià a televisió l’any 1977, per a la qual realitzà El túnel i Mala racha, i més tard Total (1985). En cinema ha dirigit Pares y nones (1982), El bosque animado (1987, premi Fantasporto i menció d'honor al Festival de Sant Sebastià), Amanece, que no es poco (1988), que es convertí en un clàssic del surrealisme cinematogràfic, La viuda del capitán Estrada (1991), La Marrana (1992), Tocando fondo (1993), Así en el cielo como en la tierra (1995), La lengua de las mariposas (1999, Goya al millor guió adpatat i premi Ondas la millor director), el curt Primer amor (2000), La Educación de las hadas (2006), Los girasoles ciegos (2008, premi Goya al millor guió adpatat), el documental Ribeiros do Avia (2010), Todo es silencio (2012) i Tiempo después (2018). En televisió dirigí un bon nombre d'episodis de la sèrie Makinavaja (1993-95) i dirigí també un episodi del film col·lectiu ¡Hay motivo! (2004). Com a actor, a més d'alguns papers en els seus propis films, interpretà Demasiado para Gálvez (1980), d’A.Gonzalo, El rey pasmado (1991), d’I.Uribe, Tesis (1996), d’A.Amenábar, i Sidoglio Smithee (1998), de J.Molina, entre altres títols. Fou descobridor del directorAlejandro Amenábar, amb qui produí Tesis (1996), Abre los ojos (1997) i Los otros (2001).