De família d’industrials surers, estudià a Anglaterra. Home d’interessos molt diversos, fou un pioner de la meteorologia científica a Catalunya amb la creació de l’observatori de Sant Feliu de Guíxols (1926). Promogué diverses iniciatives culturals, algunes de les quals relacionades amb la música. La més important fou la creació de l'Obra del Cançoner Popular de Catalunya (1922), empresa dedicada a la recopilació exhaustiva de la tradició musical popular dels Països Catalans, que, malgrat el volum de materials aplegats, no pogué ser completada a causa de la Guerra Civil i del franquisme. L’Obra fou instituïda per la Fundació Concepció Rabell, institució que rebé el nom de la seva cunyada, de qui era també marmessor. La Fundació, que el 1926 passà a formar part de la Institució Patxot, creà també un premi de composició amb el nom de la titular. A títol personal, Rafael Patxot creà un altre concurs de composició (1919) a la memòria del seu pare, el pianista Eusebi Patxot i Llagustera (Sant Feliu de Guíxols 1846-1893), organitzat per l’Orfeó Català.