El lloc de Vilablareix apareix en els documents de diverses formes: “Vila Ablares” (882), “Vila Blares” (1019), “Vilablarex” (1200), “Vilablarexo” (1225) i “Vilablarexio” (1362, 1379, 1691). L’any 1356 hi havia 16 focs, 9 d’església, i el 1678 era lloc reial.
La primera referència de l’església data de l’any 882 (“Sancti Menna, basilica in Vila Ablares”), quan el bisbe de Girona, Teuter, reorganitzà la canònica gironina i li féu donació de diversos béns. També és esmentada l’any 1019 en la dotació de la canònia de Girona. I més tard hom en té notícia per la donació que Bernat de Fàbrica féu l’any 1167 d’un alou que hi era situat (“Sancti Menati”).
Al segle XIV n’adquiriren la senyoria els Santcliment.
Era una parròquia de l’ardiaconat de la Selva i després passà a l’arxiprestat de Girona.
L’edifici que hom pot admirar actualment, dominat per un campanar acabat en piràmide, fou refet en època moderna.