El lloc de Lentillà o Nentillà és consignat en la documentació a partir del segle X (vallis Nintilliani). L’antiga ermita de Santa Magdalena era situada entre Marquixanes i Vinçà, a la riba esquerra del riu Lentillà, molt pròxima a la carretera N-116 i l’actual oratori de Santa Magdalena. Les primeres referències documentals que s’han localitzat de l’antiga ermita daten de l’any 1299, quan en dues actes diferents es fa menció de Guillem Moysen, capellà de l’església de Lentillà. Aquesta ermita o santuari encara existia a la darreria del segle XVII, ja que l’any 1688 és citada com a hermita de Santa Magdalena de Nantillà. Com ja s’ha mencionat, prop d’on estigué enclavada l’antiga església hi ha avui dia un oratori sota la mateixa advocació.