Manquen notícies documentals d’època medieval per a poder establir si aquesta fou una de les parròquies que formaven part de la vall Stacione i que s’esmenten en l’acta de consagració de la Seu d’Urgell.
L’any 1790, el lloc d’Aiguabella tenia dues cases, i la seva església era sufragània de la Torre de Cabdella. L’any 1904 fou agregada a la parròquia de Sant Julià d’Espui.
La jurisdicció del lloc fou dels Erill fins a la fi de les senyories, al segle XIX.