Fou secretari de l’arquebisbe de París Pèire de Marca. Mort aquest, Baluze publicà l’obra del seu protector Marca Hispanica sive limes hispanicus (1688), fonamental per a la història catalana, i després fou bibliotecari de Jean B. Colbert. Lluís XIV el bandejà pel fet d’haver publicat una obra que no exalçava la casa de Borbó. Publicà diverses obres, de les quals cal destacar un estudi sobre el bisbat d’Ègara (1663), una biografia de l’arquebisbe Marca (1663), l’edició dels concilis de la Narbonesa (1668), els estudis d’Antoni Agustí sobre l’edició del Decret de Gracià (1674), i les obres que li han donat més nom: Capitularia regum Francorum (1677), Epistolae Innocentii papae III (1682) i Vitae paparum Avinonensium (1693).