Famós per la defensa que féu del general Paz, col·laborà amb ell en l’organització d’un exèrcit d’oposició a Rosas. Eliminada la tirania d’aquest pel pronunciament d’Urquiza, acudí com a representant de Córdoba a l’assemblea constituent de Santa Fe (1852), i poc temps després en fou nomenat president fins a la dissolució (1854). Elegit president de l’estat (1860) després de la batalla de Cepeda, que obligà la regió de Buenos Aires a integrar-se a la confederació argentina, el seu govern fou derrocat per l’actitud secessionista de Buenos Aires, després de la batalla de Pavón (1861). L’estat fou organitzat sota la presidència del vencedor, el general Mitre. Després d’aquests fets, Derqui es retirà de la política activa.