Fou fundat, abans del 868, sota el títol de Sant Andreu, per l’abat Atili, i unit a Sant Vicenç d’Oveix, on sembla que es traslladà la comunitat, fins que, a mitjan segle X, hom donà nova vida a les Maleses. Els comtes de Pallars li feren nombroses donacions i fou reedificada l’església, ja dedicada a sant Pere, que fou consagrada el 988 sota l’abat Isern. A la fi del segle XI passà a dependre del monestir de Gerri, del qual fou des d’aleshores un simple priorat. Fou secularitzat el 1592; hom creà un vicariat perpetu a les Maleses, dependent de la rectoria de Montsor. Tingué culte fins al començament del segle XIX. En resten escasses ruïnes, sobretot de l’església, amb dos absis, amb petites traces de pintura, sota una gran balma, tot molt abandonat.