Fill de Ptolemeu XII, es casà amb la pròpia germana Cleòpatra VII. Per congraciar-se els ocupants romans, féu matar (48 aC) Gneu Pompeu Magne, escàpol de Cèsar, però, davant el favor donat per aquest a la seva germana, el combaté i morí en la batalla d’Alexandria (47 aC).
El succeí el seu germà Ptolemeu XIV, dit Filopàtor (~59 aC - 44 aC), que governava Xipre (48 aC). Fou assassinat (44 aC) per la seva germana Cleòpatra VII, amb la qual també s’havia casat.