Fou una de les principals fortificacions musulmanes de Menorca (amb el nom de Sen Ageinz) i esdevingué el darrer reducte militar de la resistència a la conquesta d’Alfons II de Catalunya-Aragó del 1287; hi foren fets presoners el moixerif i els seus guerrers sarraïns. Al mateix segle XIII esdevingué centre d’una de les quatre universitats en què fou dividida l’illa (Universitat del castell de Santa Àgueda) fins a la formació del nucli des Mercadal (encara s’anomenà per molts anys Universitat des Mercadal i del castell de Santa Àgueda ); el 1713, i definitivament el 1840, passà a formar part del nou municipi de Ferreries.
Es conserven restes d’una antiga calçada romana i part de les muralles de l’antic castell, però el turó fou coronat posteriorment pel santuari de Santa Àgueda, on acudien dones lactants amb pregàries i exvots. L’església ha estat transformada modernament en casa de pagès, i conserva una magnífica creu de terme.