Neix al llac Tagish, al S del territori del Yukon (Canadà), i en direcció SE-NW penetra a Alaska, on pren la direcció SE-SW, i desemboca al golf de Norton, a la mar de Bering. Rep, per la dreta, el Teslin, el Big Salmon, el Pelly i el Stewart, provinents de les Muntanyes Rocalloses, el Porcupine i el Koyulik, i, per l’esquerra, el Takhini, el White i el Tanana. El seu cabal és superior a 4.000 m 3
/s.
El riu Yukon al seu pas per la localitat de Kaltag (Alaska)