Entre les seves prioritats, hi ha la transparència en els plans de defensa estatals, el control democràtic de les forces armades i la cooperació entre l’Associació i els estats membres de ple dret de l’OTAN. Hi participen països tradicionalment neutrals, com Irlanda o Suïssa, i també estats de l’antic Pacte de Varsòvia, a l’espera de l’ampliació de l’Aliança Atlàntica. L’any 2000 hi ingressà Croàcia, el 2002, el Tadjikistan, el 2006 Bòsnia i Hercegovina, Montenegro i Sèrbia i, el 2008, Malta. El 2000 creà el Fons d’Afectacions Especials, inicialment concebut per a assistir els estats membres en la desactivació i l’eliminació d’arsenals, en el desmantellament de les fàbriques i en la prohibició de la venda de mines antipersones sota les convencions del Tractat d’Ottawa. Posteriorment, aquest Fons s’ha destinat a finançar altres iniciatives de desarmament, desmilitarització i reforma de les forces armades.