S'articula en diferents seus, que actualment són el monestir de Sant Cugat del Vallès i la Casa Aymat. L’any 2003 s’inaugurà al monestir la primera fase del museu i la Generalitat de Catalunya en cedí formalment la gestió a l’Ajuntament. En el recorregut expositiu obert al públic es mostren l’arquitectura i la vida quotidiana monàstica a partir de la figura de Pere Ferrer, un monjo medieval autor del Costumari de Sant Cugat
. La Casa Aymat conté habitualment la col·lecció de tapís contemporani català realitzat a l’antiga manufactura del mateix nom de la seu. També disposa d’una sala d’exposicions temporals que acull art contemporani. Altres seus en procés de rehabilitació i museïtzació són el celler modernista de Cèsar Martinell, on una exposició permanent explicarà el pas d’una vila agrícola a una ciutat de serveis, i la vil·la romana de Can Cabassa, important centre d’explotació agrícola, en funcionament des del s I aC fins al s VII dC.