És dedicat a la recerca avançada sobre el diagnòstic i el tractatment d’un ampli ventall de malalties i transtorns de la salut, entre els quals del sistema metabòlic (fetge, aparell digestiu, nutrició), oncologia i immunologia, malalties neurològiques, malalties relacionades amb la pobresa i el desenvolupament de tecnologies de diagnòstic i terapèutiques.
Absorbeix part dels serveis de l’Institut d’Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer (IDIBAPS), vinculat a l’Hospital Clínic, a la Facultat de Medicina de la Universitat de Barcelona i l’Institut d’Investigacions Biomèdiques de Barcelona - CSIC, al voltant dels quals s’articula conjuntament amb altres centres de recerca, entre els quals l’Institut Josep Carreras de Recerca contra la Leucèmia.
El CIBEK té l’origen en la donació que Esther Koplowitz a través de la Fundació Esther Koplowitz efectuà l’any 2005 per a la construcció del centre a partir de la iniciativa de la Fundació Clínic per a aquest mateix projecte. Rep també el suport de la Generalitat de Catalunya, de la Universitat de Barcelona i de l’Institut Carles III del ministeri de ciència i innovació del govern espanyol. En el moment de la seva inauguració era la iniciativa de mecenatge més quantiosa per a un centre de recerca científica a l’estat espanyol.
Amb una capacitat per a més de 400 investigadors, l’edifici ocupa una parcel·la de 3.000 m2 del carrer Rosselló de Barcelona, contigu a l’Hospital Clínic, 1.000 m 2 dels quals són edificats i la resta, cedits a l’ajuntament de Barcelona, es destinen a parc urba. En total, les cinc plantes sobre el nivell del terra ocupen una superfície total de 6.500 m2, als quals hom ha d’afegir uns 2.500 m2 distribuïts en tres plantes subterrànies.