Forma part d’un complex de coves subterrànies a la regió. Fins el 2018 les identificades com a més extenses eren el sistema Ox Bel Ha (270 km), el Sac Actun (263 km), el Kook Baal (93 km) i el Dos Ojos (83 km). A l’inici del 2018 el projecte d’investigació Gran Acuífero Maya anuncià el descobriment de la connexió dels sistemes Sac Actun i Dos Ojos. Arran de la descoberta, i seguint la convenció de l’espeleologia, el nou sistema de coves adoptà el nom de la més gran. Amb un total de 347 km, el sistema Sac Actun es convertí aleshores en el conjunt de galeries subaquàtiques conegut més extens del món.
Cenote Kalimba, del sistema Sac Actun
Asbjørn Hansen (CC BY-NC-ND 2.0)
L’origen de Sac Actun i de la resta de sistemes subaquàtics de Yucatán es troba en la naturalesa calcària del terreny, l’erosió del qual per l’aigua de la pluja i la seva filtració al subsol produí grans cavitats submergides (cenotes). Els cenotes, alguns dels quals tenen l’aspecte de llacunes a causa de l’ensorrament de la volta superior, tingueren una gran importància en la civilització maia, tant per al proveïment d’aigua com en funcions rituals i religioses, com proven els nombrosos temples edificats en la seva proximitat.