El 1697 entrà a forma part del cor de nens de la capella musical d’Ansbach. Estudià cant amb F.A.M. Pistocchi i violí amb G. Torelli. El 1709 abandonà Ansbach per anar a Leipzig, però acabà el seu viatge a Weimar, on conegué J.S. Bach. El 1712 fou contractat com a violinista a l’orquestra de la cort de Dresden. Durant els seus primers anys en aquesta ciutat realitzà nombroses gires, tot visitant França, Berlín i Itàlia. Estudià amb A. Vivaldi a Venècia i amb F. Montanari a Roma. Pisendel fou el violinista alemany més notable de la seva època. Diversos autors rellevants, com A. Vivaldi, T. Albinoni o G.Ph. Telemann, li dedicaren composicions. La seva breu producció instrumental és d’una alta qualitat artística i mostra influències d’A. Vivaldi i J.S. Bach. Entre els seus deixebles més destacats hi hagué J.G. Graun i F. Benda.