S’inicià en la música amb el seu pare i Augustin Pierson, de qui aprengué orgue i piano. El 1927 ingressà al Conservatori de París, on estudià harmonia, fuga, orgue i composició amb P. Dukas i Jean Roger-Ducasse. Tot i la seva curta carrera compositiva, esquinçada per la seva mort al front durant la Segona Guerra Mundial, Alain demostrà posseir un gran talent manifestat en una forta personalitat musical, no exempta d’influències provinents de compositors com C. Debussy, E. Satie o O. Messiaen.