A quinze anys ja realitzà un primer curt força sorprenent, La agonía de Agustín (1975). Amb manifestacions cinematogràfiques de petit format, o de manera més privada i entre amics, continuà el procés d’autoaprenentatge i de recerca d’una manera pròpia d’expressar-se amb films de totes les mides i formats: curts i llargs en 8, 16 i 35 mm. En 8 mm realitzà El orificio de la luz (1977); Apuntes de un rodaje (1982), que és una mena de making off personal de Dulces horas de Carlos Saura; Elogio a las musas (1977) i La dramática pubertad de Alicia (1978). Afrontà el pas dels 16 als 35 mm amb Memorias de un paisaje (1979) i Naturaleza muerta (1981), respectivament. També realitzà Film familiar (1976-78), Diario de Marga (1980) i Retrato de Vicky (1982, vídeo). El tema de la pubertat, recurrent en la seva filmografia inicial, es consumà al primer llarg que feu en 35 mm, Los motivos de Berta (Fantasía de pubertad) (1983), que topà amb problemes de distribució però tingué una extraordinària acollida per part de la crítica i els festivals més prestigiosos. El 1988 realitzà "Eulalia - Marta. Abril 1988" com a part de City Life, un film d’episodis impulsat pel Festival de Rotterdam per tal de donar suport als nous talents del cinema europeu. La seguí Innisfree (1988-90). Amb aquest film encetà una manera de fer cinema reflexiva i rigorosa, que dona molta importància a la fase de muntatge. En aquesta línia realitzà Tren de sombras (1996-97). Arran de l’activitat docent de Guerín, i concretament de la seva participació en el mestratge de documental de creació de la Universitat Pompeu Fabra, nasqué En construcció (1998-2001). Aquesta mirada punyent a la transformació urbanística i social del Raval ha obtingut una magnífica acollida no sols de la crítica, sinó del públic; el millor premi a la tenacitat de Guerín, que entre molts altres guardons ha rebut el Nacional de Cinematografia 2001 del Ministeri de Cultura en reconeixement a tota la seva trajectòria.
1976 Furvus (CM).
1977 Acuérdate de Isabel (CM).
1986 Souvenir (CM); 40 años de moda española (migmetratge documental de la sèrie tv De moda).
d. a.: Dossier José Luis Guerín i Guerín sobre "En construcció", "Projeccions de cinema", núm. 2, 2000, p. 18-39, i núm. 4, 2002, p. 4-16; El cine de José Luis Guerín: La pureza de la mirada, "Solaris", núm. 4, 1991, p. 42-54; Reencuadres: José Luis Guerín, "Banda Aparte", núm 12, 1998, p. 17-37.
GARCIA I FERRER, J.M. i MARTÍ I ROM, J.M.: "Surcando el jardín dorado" (Un viatge pels films de J.L.Guerín i les fotografies d’E.Momeñe). Cineclub de l’Associació d’Enginyers, Barcelona 1984.
TORRES, S.: Los motivos de Guerín, "Nosferatu", núm. 9, 1992, p. 38-47.