La seu ocupa un edifici projectat per l’arquitecte Gabriel Alomar al carrer de Sant Roc, als terrenys que fins aquell moment ocupava l’edifici de l’antiga Universitat Lul·liana. Les obres començaren a l’abril del 1950 i no conclogueren fins el 1972. La creació d’aquest centre tingué el suport de la Universitat de Barcelona, l’Ajuntament de Palma, que cedí els terrenys, i la Diputació de Balears. El 1950 es constituí un patronat que redactà un avantprojecte d’estatut que perfilava la idea de crear un centre d’estudis universitaris en col·laboració amb la UB i un Institut d’Estudis de Balears, a més de començar una tasca de foment de creació d’associacions culturals que tindrien la seu a l’Estudi General. Finalment, el rector de la UB (12 de maig de 1951) nomenà el primer consell rector de l’Estudi General Lul·lià, constituït per Gerard M. Tomàs (rector), Joan Pons i Marquès (vicerector), Gabriel Rabassa Oliver (secretari general), Jaume Cirera Prim (tresorer), Jaume Lladó i Ferragut (arxiver) i sis vocals. Posteriorment, n’han estat rectors Francesc de B. Moll, anteriorment vocal del consell fundacional, Josep Font i Trias i Gabriel Oliver Coll.
Es configurà com un institut dividit en diverses seccions: Ciències Naturals i Geografia; Dret, Ciències Socials i Econòmiques; Filosofia, Història, Arqueologia i Art, i Lul·lisme. L’ensenyament universitari, que començà el mateix 1951, consistí en els dos primers cursos de la llicenciatura de dret i els cursos comuns de filosofia i lletres. Després del curs 1956-57 se suspengué per manca de suport de la UB i per l’escassa implicació econòmica de l’Ajuntament i la Diputació Provincial. Els estudis universitaris no foren recuperats fins el 1967, any en què la UB creà a Palma una delegació de la seva Facultat de Filosofia i Lletres amb la seu a l’Estudi General fins el 1973, i que fou la base de la constitució de la Universitat de les Illes Balears.
Des de la seva fundació, l’Estudi General Lul·lià ha dut a terme a Mallorca una tasca molt important per a la cultura. A part dels estudis universitaris, ha patrocinat nombroses publicacions, ha acollit congressos, concerts i conferències, ha realitzat cursos de castellà per a estrangers, ha promogut la normalització lingüística a través de cursos de català i és un centre fonamental en l’ensenyament de llengües estrangeres mitjançant l’Institut de Llengües Modernes, creat el curs 1952-53. Ha contribuït a la tasca d’altres entitats culturals, integrant-les o hostatjant-les d’una manera temporal o definitiva, com ara l’Escola d’Assistents socials (1959-84), l’Escola de Turisme de Balears (1965-83), l’Escola Universitària de Treball Social, la Societat d’Història Natural, l’Associació d’Amics del Museu Marítim i l’Associació d’Amics dels Molins.
La importància de l’Estudi General Lul·lià per al desenvolupament de la historiografia a Mallorca rau bàsicament en l’ensenyament universitari dels cursos comuns de filosofia i lletres (1951-57 i 1967-73). Aquesta tasca docent comptà amb figures de la talla d’Àlvar Santamaria i Arández, Guillem Rosselló i Bordoy o Bartomeu Font i Obrador. A més, el 1959 creà la càtedra Ramon Llull, adscrita a la Facultat de Filosofia i Lletres de la UB, per al foment de la investigació i divulgació de l’obra del filòsof mallorquí i per a la creació d’un Seminari d’Estudis Medievals. Les conferències i cursos sobre temes històrics han estat molt nombrosos al llarg dels anys. Entre els ponents més destacats cal esmentar Jaume Vicens i Vives i Miquel Batllori.
L’Estudi General Lul·lià formà part de la Comissió Executiva dels Congressos de la Corona d’Aragó i patrocinà algunes investigacions rellevants, com la redacció i catalogació de 10.000 fitxes de toponímia i antroponímia de les Balears, a més de la publicació d’algunes obres interessants: Bibliografía arqueológica de las Baleares (Mallorca y Menorca) (1958), de Gabriel Llompart, Historia del Estudio General Luliano y de la Real y Pontificia Universidad Literaria de Mallorca (1973), de Lladó i Ferragut, Romanticismo y fin de siglo (1992), coordinat per Gabriel Oliver, Mallorca i el Nou Món (Califòrnia) (1992), de Font i Obrador, i Mallorca i el Món Clàssic (1991 i 2000), en dos volums, de M.C. Bosch i P.J. Quetglas.
- LLADÓ I FERRAGUT, J.: Historia del Estudio General Luliano y de la Real y Pontificia Universidad Literaria de Mallorca, Cort, Palma 1973.
- PIÑA HOMS, R.: La Universidad Balear. Entre la realidad y el mito, Cort, Palma 1973.