Aquesta publicació és l’element principal de difusió dels estudis del Cercle. Cada número de la revista està dedicat a un tema de recerca: hi ha, doncs, una relació d’articles que hi fan referència, o la publicació de ponències, conferències o col·loquis realitzats prèviament sota l’empara del Cercle. En els Quaderns, hi han participat fins ara historiadors de renom de les universitats catalanes que han tractat temes que van més enllà de les comarques gironines, centrant de vegades debats historiogràfics per tot Catalunya. Cal destacar, entre d’altres, els volums següents: Reflexions metodològiques sobre la història local (núm. 1, 1984); La Guerra Civil a les comarques gironines (núm. 2, 1986), actes de les Jornades d’Estudi Commemoratives del Cinquantenari de la Guerra Civil, a l’abril del 1986; La historiografia catalana (núm. 6, 1990), publicació d’un cicle de cinc conferències, i Temps de postguerra. Estudis sobre les comarques gironines, 1939-1955 (núm. 16, 2000).