Es coneixen poques referències d’aquest lloc, que apareix ja des del segle XII com una dependència del terme del castell d’Orcau, el senyor del qual era qui nomenava el batlle de la vila.
Vers l’any 1526 la rectoria de Soterranya, dins de l’oficialat de Tremp, era unida a la de Puigfalconer i l’obtenia Ramon Serradells. El 1758 Sant Serni de Suteraña era parròquia independent; l’edifici es trobava en bon estat, encara que la teulada necessitava reparació. Actualment depèn de la parròquia de Vilamitjana.