Aquesta església era emplaçada on avui dia s’alça la capella de la Mare de Déu de l’Ametllera, al peu de la serra del Castell de Llaguarres, al sud-est de la vila de Lasquarri. Una de les primeres mencions documentals d’aquesta església data del 1098, any en què el bisbe Ponç de Roda amb l’aprovació dels clergues de Roda i en presència de l’arquebisbe de Tarragona, Berenguer Sunifred de Lluçà, concedí al monestir de Sant Pere de Rodes i al seu abat Ramon l’església de Sant Just d’ipsa Millera; el bisbe s’hi reservà, però, la quarta part dels béns episcopals i la col·lació dels preveres i sacerdots. La noticia d’un “abat” de l’Ametllera, dit Domènec Ferrer de Calbera l’any 1290, confirma la continuïtat en aquest lloc d’una comunitat de clergues regida per un abat.