Fundat el 1919, nasqué com a continuació del Mollet SC. Durant els anys trenta jugà el Campionat de Catalunya de segona categoria. La temporada 1953-54 ascendí a tercera divisió estatal, on competí quatre temporades fins a l’edició de 1957-58. Posteriorment tornà a categories territorials. El 1993 es fusionà amb la UD Fliselina, originant el CF Mollet-Fliselina, i l’any 2000 amb l’Atlètic Zona Sud per crear l’actual CF Mollet UE. Disposa d’equips en categories inferiors i escola de futbol de base. Des del 1993 juga al camp municipal Germans Gonzalvo, construït en honor dels germans Juli, Josep i Marià Gonzalvo. Té equips de futbol sala.