Fou oïdor de l’audiència de Panamà. Enviat al Paraguai per tal de resoldre les diferències entre els indis i el governador d’Asunción, Diego de los Reyes Balmaseda, destituí aquest. No tardà a adherir-se a les posicions dels criolls; expulsà els jesuïtes d’Asunción i intentà d’acabar amb llurs missions i amb el repartiment dels indis en mitas. La seva rebel·lió fou finalment esclafada per les milícies dirigides per Bruno de Zabala. Antequera fou condemnat a mort i morí en un aldarull que es produí quan l’anaven a ajusticiar.