Neix al Pirineu navarrès; el curs alt és anomenat Bastanzubi, i Baztan fins a Doneztebe. Flueix en direcció S-N fins a Uranzu (Irun), i desguassa a la mar Cantàbrica. Des d’Endarlaza fins a la desembocadura el riu serveix de frontera entre l’Estat espanyol i l’Estat francès. El seu règim és pluvial. El Bidasoa és aprofitat per a moure centrals hidroelèctriques i és travessat per ponts internacionals de carretera i de ferrocarril.