Les primeres instruccions, capitulacions i lleis complementàries foren unificades el 1573 a les Ordenanzas de descubrimientos y nueva población de Felipe II. El problema de l'encomienda motivà les Leyes de Burgos (1512) i les Leyes Nuevas (1542), que toparen amb una forta oposició. Les lleis foren recopilades diverses vegades, la darrera de les quals fou la Recopilación de leyes de los reinos de Indias (1680).