Governador d’Oaxaca (1847-52), del 1853 al 1855 romangué exiliat a l’Havana. Liberal, inspirà com a vicepresident la constitució del 1857. President (1860), després d’una guerra civil, la seva política anticlerical i la decisió de suspendre el pagament del deute exterior proporcionaren a França, Anglaterra i Espanya el pretext per a una intervenció armada (1861). Les forces angleses i espanyoles (aquestes manades pel general Prim) signaren l’acord de Soledad (1862) i reembarcaren. Els francesos ocuparen la ciutat de Mèxic (1863) i imposaren per la força l’emperador Maximilià. Juárez es refugià a Paso del Norte, des d’on organitzà la resistència. El 1867, retirades les tropes franceses i afusellat Maximilià, Juárez ocupà la presidència, fins a la mort.