A partir de Versuch über die Transzendentalphilosophie (‘Assaig sobre la filosofia transcendental’, 1790), qualificada per Kant com la crítica més aguda a la seva filosofia, aconseguí un gran predicament. Ultra nombrosos comentaris a Aristòtil, Maimònides i Bacon, escriví Versuch einer neuen Logik oder Theorie des Denkens (‘Assaig d’una nova lògica o teoria del pensament’, 1794), intent d’exposició d’una lògica simbòlica, Kritische Untersuchungen über den menschlichen Geist (‘Investigacions crítiques sobre l’esperit humà’, 1797) i l’autobiografia Salomon Maimons eigene Lebensgeschichte (1792).