És situat a la sala capitular de la catedral i en algunes dependències annexes al claustre de la Mercè, traslladat a aquest lloc el 1942. De les seves col·leccions destaca l’orfebreria, la marededeu del Capítol i un crucifix romànic. Té un interès especial la tela que representa la temptació de sant Tomàs d’Aquino, pintada per Velázquez el 1633 per al col·legi dominicà d’Oriola.