Utilitza diferents suports i tècniques, com fotografies i texts, instal·lacions, llibres, objectes i pel·lícules. La seva obra es caracteritza per la intrusió en la intimitat i la seva difusió pública, i s’aplega en diferents sèries, com Els dorments, en què retrata amics i coneguts mentre dormen, relacions de parella, etc; la Suite veneciana, en què fotografia un home durant una estada a Venècia, d’incògnit; El detectiu, un reportatge sobre ella encarregat a uns detectius; Els cecs, recull de fotografies de persones cegues al costat de texts que expliquen com senten les coses; L’absència, realitzada a partir del robatori de quadres i objectes en un museu, amb imatges del lloc que ocupaven i un text del personal del centre que explicava el record que en tenia; Autobiografies (el marit), on narra l’itinerari de la relació en una parella; les fotografies de Tombes; o la sèrie Ritual d’aniversari, on exposa en vitrines els objectes que li han regalat pel seu aniversari durant diferents anys. Ha presentat una exposició retrospectiva a la Fundació “la Caixa” (1997) a les seus de Madrid i de Barcelona. És un personatge de ficció de la novel·la de Paul Auster Leviathan (la fotògrafa Maria Turner). El 2007 presentà, al pavelló francès de la Biennal de Venècia, el projecte Prenez soin de vous. El mateix títol dóna nom a un catàleg, en què l’art narratiu de Calle restitueix la complexitat de les relacions humanes.