Fundat el 10 d’octubre de 1996, nasqué com a hereu de la desapareguda secció d’atletisme del Club Natació Figueres, que els anys vuitanta destacà en l’àmbit estatal amb atletes com l’olímpica Imma Clopés, les germanes Eva i Núria Velasco o Concepció Ramada. Aquest grup d’atletes, dirigit per Josep Maria Quintana i Jordi Blanch, competí a la Lliga estatal tot i entrenar-se en unes pistes no reglamentàries de pols de marbre. La temporada 1993-94 la secció d’atletisme del CN Figueres es fusionà amb el Centre Atlètic Laietània de Mataró. Tanmateix acabà desapareixent. El nou CA Figueres revitalitzà l’atletisme de la ciutat i l’any 1999 s’hi inaugurà el nou estadi Albert Gurt, en homenatge al marxador figuerenc. El 2000 s’uní a altres clubs gironins per formar el Girona Costa Brava, nom sota el qual competien els atletes a partir de la categoria cadet; des de llavors treballa amb l’escola d’atletisme en l’àmbit local i comarcal, i amb el Girona Costa Brava en les competicions catalanes i estatals. La temporada 2016-17, la junta presidida per Margarida Clopés emprengué una nova trajectòria en solitari i els atletes de totes les categories competeixen en tots els àmbits territorials sota el nom de Club Atletisme Figueres.