Fundat l’any 1981, participa en competicions de la Lliga Catalana de clubs. El 1987 es fusionà amb el Grup Esportiu Parellada, del qual prengué en part el nom i creà el Grup Esportiu Parellada Sant Boi. La temporada 1989-90 organitzà el Campionat de Catalunya d’atletisme júnior i la 1990-91 el Campionat d’Espanya promesa, en què participaren més de 500 atletes. A principi dels anys noranta començà a utilitzar les pistes municipals d’atletisme. L’any 2000 prengué el nom actual. Disposa d’escola d’atletisme i equips en totes les categories d’edat. També practica triatló, duatló i curses de muntanya. Pel que fa a atletes, destaca Marta Bosch, subcampiona d’Espanya absoluta de 800 m llisos.