Fou fundada l’any 1975 i Jordi Avances Brunet en va ser el primer president. Des d’aquell primer moment, en la promoció d’aquest esport a Catalunya, a més dels directius de la mateixa federació, cal destacar el paper d’Andreu Morros, des de la presidència de la federació espanyola, o Isidre Oliveras, des de la presidència de la Unió Mundial. S’encarrega de la promoció i la regulació a Catalunya de totes les modalitats de l’esquí nàutic (eslàlom, figures, salts, curses i esquí-surf). Ha acollit diversos campionats internacionals de primer nivell, com el Campionat d’Europa júnior (Banyoles, 1984), el Campionat Mundial de Curses (Blanes-Balís-Barcelona, 1985), el Campionat d’Europa Sub 21 (Canal Olímpic de Castelldefels, 1993), diversos campionats europeus (Port Ginesta, Roc de Sant Gaietà, Sant Carles de la Ràpita) o la Spanish Masters (1987-1992, al riu Fluvià). Té 12 clubs inscrits i 371 esportistes federats (2009).