S’inicià en l’equip del Grup d’Empreses Seat de Barcelona (1975), i posteriorment fitxà pel Futbol Club Barcelona (1983-86), pel Club Nike (1986-89) i la Unió Colomenca d'Atletisme (1995-2000). Fou campió de Catalunya júnior de 5.000 m en pista a l'aire lliure (1976) i absolut de 1.500 m en pista coberta (1978), de 5.000 m en pista a l'aire lliure (1984, 1986) i de marató (1986), i encapçalà el rànquing absolut de Catalunya en la prova dels 10.000 m llisos en pista a l'aire lliure (1983, 1984 i 1986). També aconseguí la tercera posició en categoria sènior de la Cursa Jean Bouin (1983), al Campionat d’Espanya absolut de 5.000 m (1984) i de marató (1987). Guanyador dues vegades de la cursa d'El Corte Inglés (1983 i 1985), fou segon en la Marató de Barcelona (1986) i aconseguí la seva millor marca en la Copa del Món (1987), amb un registre de 2.15.06 h. Participà en la prova de marató dels Jocs Mediterranis del 1987, on acabà en setena posició, i en tres Copes d'Europa de Clubs (1984, 1985 i 1986), en la prova de 10.000 m llisos en pista a l'aire lliure amb el FC Barcelona. En la categoría de veterans M-40 es proclamà campió de 1.500 m llisos (1999) i subcampió de 5.000 m llisos (1999), en pista a l'aire lliure, i subcampió en la prova de 3.000 metres llisos en pista coberta (1998) dels Campionats d'Espanya. Com a veterà M-40 també es proclamà campió de Catalunya en 1.500 m llisos (1999) i 5.000 m llisos (1999), en pista a l'aire lliure, en ruta de marató (1999) i mitja marató (2000). L'any 2000 es retirà de la competició.
Juan Antonio Balsera Pérez a l’arribada al parc de la Ciutadella en la marató de Barcelona, en què fou segon (1986)
Arxiu J.A. Balsera