Inicià la seva carrera competint en bicitrial amb els equips Rabasa Derbi i Looping. Aconseguí dues Copes d’Europa en categoria aleví (1983, 1984) i un Campionat del Món infantil (1986). Amb motos, guanyà el Campionat d’Espanya júnior (1990) i el sènior B (1991) amb Gas Gas. Fou campió d’Europa (1992) i guanyà quatre vegades consecutives el Trial de les Nacions amb l’equip espanyol (1992-95) competint amb Beta i Gas Gas. L’any 1996 fitxà per Fantic i després tornà a Gas Gas. Participà en vuit Campionats del Món (1992-99), en què destacà la tercera posició. Assolí quatre podis en grans premis del Mundial, amb un segon i tres tercers llocs. L’any 2001 fundà el Joan Pons Trial Team, d’on sorgiren talents com Laia Sanz, Toni Bou o Dani Oliveras. Els anys 2003 i 2004 tornà a competir, ara amb Sherco, en competicions puntuals, com el Campionat d’Itàlia, on aconseguí dues victòries i guanyà els Sis Dies Internacionals de Trial el 2003. Des del 2007 es dedica a la formació de joves pilots a la Joan Pons Trial School (1997), situada a Canyamars, i també dirigí la Sherco Academy.