En 543-544 havia publicat un edicte dogmàtic on condemnava els Tres Capítols (obres de Teodor de Mopsuèstia, de Teodoret de Cir i d’Ibes d’Edessa). Els 151 bisbes orientals presents al concili condemnaren també aquestes obres. El papa Vigili, present a Constantinoble, no hi prengué part i primerament es refusà a aprovar-lo, però acabà fent-ho, a l’exili, com ja d’antuvi havia condemnat els Tres Capítols , cedint més d’una vegada a les pressions imperials. El concili fou una revisió del de Calcedònia, i durant força temps l’Occident es refusà a admetre'l. El concili condemnà també l’origenisme i confirmà el cànon 28 de Calcedònia sobre els drets de la seu patriarcal constantinopolitana.