Absorbí el cante hondo de l’entorn familiar i vers els 15 anys anà a Madrid on, conegut com El Granaíno, freqüentà els locals de flamenc. Debutà vers l’any 1964, any en què es feu professional i cantà a la Fira Mundial de Nova York.
L’any 1967 publicà el seu primer disc Cante Flamenco i aviat es convertí en un dels més destacats representants de la nova generació de cantaores, fidels a la tradició i alhora oberts a altres músiques, com ho proven les seves col·laboracions amb Pat Metheny, Lagartija Nick, Sonic Youth, Pat Metheny, Ute Lemper i Khaled. Interpretà també poemes, especialment de Federico Garcia Lorca i Miguel Hernández.
La seva discografia inclou, entre d’altres, Cantes antiguos del Flamenco (1968), Homenaje Flamenco a Miguel Hernández (1971), Se Hace Camino al Andar (1975), Homenaje a D. Antonio Chacón (1977), Despegando (1977), Sacromonte (1982), Cruz y Luna (1983), Esencias Flamencas (1988), Nueva York / Granada (1990), Misa Flamenca (1991), Negra, si tu supieras (1992), La Estrella (1996), Omega (1996), Lorca (1999), El pequeño reloj (2003), Morente sueña la Alhambra (2005), Pablo de Málaga (2008), Morente flamenco (2009). Rebé la Medalla d’Andalusia (2005) i la Medalla d’Or al Mèrit de les Belles Arts (2006) del Govern espanyol.