La Niña es produeix quan els vents de l’E s’intensifiquen de manera anòmala tot provocant un desplaçament més gran de les aigües superficials que hi ha sobre la costa del Perú cap a l’W. Aquest desplaçament indueix al mateix temps una intensificació de l’aflorament d’aigües fredes, la qual cosa comporta un refredament de les aigües del Pacífic equatorial; a les aigües superficials al llarg de l’Equador s’han observat disminucions de fins 4ºC per sota de la seva temperatura normal. A l’atmosfera, La Niña es manifesta fent que la zona de convecció es desplaci més cap a l’W, de manera que la pluja és més abundant sobre la regió d’Indonèsia. El fenomen succeeix cada pocs anys i persisteix aproximadament durant 9-12 mesos, si bé alguns episodis poden prolongar-se fins dos anys.