De la línia primogènita, comtal, sorgiren diferents línies secundàries. La línia dels comtes de Rabat fou originada per Llop de Foix (mort després del 1259), segurament senyor de Saverdun, fill il·legítim del comte Ramon Roger I. Els seus descendents foren també marquesos de Foix, i s’extingiren el 1698. La línia dels vescomtes d’Ossau fou fundada per Garcia de Foix o de Bearn (mort el 1399), primer vescomte de la vall d’Ossau, fill il·legítim del comte Gastó III. Els seus descendents es cognomenaren d’Ossau. El vescomtat d’Ossau fou confiscat el 1463 al seu net Corberan d’Ossau (mort el 1463) i fou annexat al vescomtat de Bearn. La línia dels ducs de Medinaceli sorgí de Bernat de Foix o de Bearn, dit el Bastard de Bearn, primer comte de Medinaceli, fill legitimat (1371) del comte Gastó III, els descendents del qual es cognomenaren de la Cerda. La línia dels vescomtes de Lautrec fou iniciada per Pere de Foix, vescomte de Lautrec i de Vilamur (Tolosà), fill del comte Joan I. Dels seus nets, Francesca de Foix (morta el 1537) fou amistançada de Francesc I de França, Tomàs de Foix (mort el 1525) fou mariscal de França i Odet de Foix (mort el 1528), vescomte de Lautrec i Vilamur, fou comte de Comenge, de Rethel i de Beaufort, governador de Milà, Guiena i Llenguadoc i mariscal de França. S'extingí amb el fill d’aquest, Enric de Foix (mort el 1540), comte de Comenge, i aquest comtat fou incorporat a la corona francesa. La línia il·legítima dels senyors de Gerderèst fou fundada per Bernat de Foix, senyor de Gerderèst i senescal de Foix, i s’extingí al s. XVI. La línia dels comtes de Candale i de Benauges fou formada per Gastó de Foix, comte de Benauges, senyor de Grailly i cabdal de Buch, fill de la comtessa Elisabet I. Fou fill seu Joan Gastó de Foix (mort vers el 1485), comte de Candale, Lavaur i Benauges i lloctinent general de Rosselló i Cerdanya per Lluís XI de França (1463), que li atribuí els béns confiscats als rebels catalans d’aquests comtats. Es casà amb l’anglesa Margaret de la Pole, hereva del comtat de Kendall. La seva neta Anna de Foix (morta el 1506) fou muller del rei Ladislau II d’Hongria i Bohèmia. El germà d’aquesta, Gastó de Foix (mort el 1536), comte de Candale i de Benauges, heretà per matrimoni (1508) el comtat d’Astarac, i la línia s’extingí amb la besneta d’aquest, Maria de Foix (morta el 1593), muller (1587) de Jean Louis de Nogaret de la Valette, duc d’Épernon. De la línia de Candale eixiren diverses branques: la branca dels comtes de Gurson, que fou començada per Joan de Foix (mort vers el 1521), comte de Gurson i vescomte de Melas, fill de l’esmentat Joan Gastó de Foix, comte de Candale, i que s’extingí amb el seu quadrinet Enric Francesc de Foix (mort el 1671), duc de Randan i comte de Gurson i de Fleis; la branca dels barons de Doasit, que fou iniciada per Francesc de Foix, baró de Doasit, fill il·legítim de l’esmentat Joan Gastó, i de la qual derivà la subbranca dels barons de Lau; i finalment la branca rossellonesa dels Foix-Bearn o dels Bearn, que fou formada per Guillem de Foix-Bearn, fill il·legítim del fundador de la línia de Candale. Els Foix o Foix-Bearn o Bearn del comtat de Rosselló posseïren les senyories de Bompàs, Sureda, Oltrera i Santa Eugènia i Sant Joan de Pladecorts.
Armes dels Foix
Llinatge feudal sortit de les dues primeres dinasties de la casa comtal de Foix, l’estirp del qual és el primer comte de Foix, Roger I.