Fou el cap dels cubans que el 1868 projectaren la revolta contra la dominació espanyola. L’aixecament era previst per al novembre, sota la seva direcció, però una sèrie de circumstàncies féu que Céspedes s’avancés (Grito de Yara, a l’octubre). Ocupà (1869) el càrrec de vicepresident de la república i de lloctinent de les guerrilles. Aguilera fou posteriorment encarregat d’una sèrie de gestions a l’estranger per obtenir suport.