Les col·leccions d’art propietat de Solomon R.Guggenheim passaren a la fundació i, el 1959, s’instal·laren al museu Guggenheim de Nova York, obra de Lloyd Wright. Peggy Guggenheim instal·là la seva col·lecció d’art en un palau de Venècia, el 1951, avui gestionat per la fundació. El 1992 s’inaugurà a Nova York el Museu d’Art Contemporani Guggenheim, en un edifici del Soho restaurat per Arata Isozaki. El 1997 s’inaugurà un nou museu a Bilbao, en un edifici de Frank Gehry.