Rebé el nom inicial de Fundació Biblioteca Josep Pla i en la primera etapa eren representats en el patronat l’Ajuntament de Palafrugell i la Diputació de Girona. L’any 1990 s’aprovaren els estatuts, i el 1992 passaren a formar part del patronat, a més de les institucions esmentades, la Generalitat de Catalunya i el Consell Comarcal del Baix Empordà. L’any 2000, amb el suport de la Fundació “la Caixa”, última entitat a incorporar-se al patronat, rebé un fort impuls, i a partir d’aleshores les seccions principals comprenen, a més de la biblioteca, un centre de documentació, una exposició permanent amb material audiovisual i objectes vinculats a l’escriptor, i un espai d’exposicions temporals, entre d’altres.
Amb seu successivament a la casa natal de l’escriptor i en una casa veïna de Palafrugell (des del 1995), té com a tasca reunir i preservar el llegat literari de l’escriptor i difondre i estudiar la seva obra i la seva figura. L’any 2010, fruit d’un conveni entre el patronat de la Fundació, el Grup 62 i la Universitat de Girona, fou creada la càtedra Josep Pla, amb seu permanent en aquesta universitat i una seu territorial a la Fundació. Aquesta càtedra, el 2023, estrenà la plataforma digital interactiva Hemeroteca Josep Pla, que reuneix tota la producció periodística de l’escriptor (més de 6.000 articles).
L’any 2023, els hereus de Josep Maria Cruzet donaren a la Fundació una trentena de volums de la correspondència manuscrita i mecanoscrita entre l’editor i Josep Pla.