Filla de Joan de Borja, segon duc borgià de Gandia. Professà, amb el nom de Francesca de Jesús, al monestir de clarisses descalces de Gandia, del qual fou abadessa. El 1551 fundà el monestir de Las Descalzas Reales de Madrid. Escriví unes Exhortaciones espirituales i uns Ejercicios santos.