El seu objectiu principal és la formació d’una unió duanera, aconseguida el 1966 amb l’establiment d’una tarifa duanera comuna per a la consecució d’una política comercial unitària. El tracte fou subscrit per Costa Rica, El Salvador, Guatemala, Nicaragua i Hondures; Panamà actua com a país associat. A partir del 1970, a causa de la inestabilitat política de la zona, el MCCA entrà en una crisi: Hondures abandonà l’organització el 1971 i Costa Rica, el 1972.