Del seu fons destaquen les col·leccions d’arqueologia ibèrica, romana i medieval, provinents de les campanyes d’excavació al municipi, i la col·lecció d’estris i eines del camp procedent de la Cambra Agrària local. El 2011 s’inaugurà Can Barraquer, la casa on visqué i morí Rafael Casanova, com a seu principal del museu i nucli de dinamització del patrimoni cultural local, amb els espais d’acollida, dues exposicions permanents (“Sant Boi: temps i espai” i “Rafael Casanova i el seu temps”), exposicions temporals i sala per a activitats didàctiques. El museu disposa, a més, dels equipaments de Can Torrents, les termes romanes i la torre de Benviure.