Contrari a la dictadura de Porfirio Díaz, el 1906 fundà, als EUA, el Partido Liberal Mexicano, que adoptà la ideologia socialista, reivindicà un programa revolucionari d’intervencionisme estatal i inspirà el moviment obrer mexicà. El 1911 fracassà la insurrecció organitzada per ell i el seu germà a Califòrnia, però el president Francisco Madero cercà la seva col·laboració, que Flores li negà. Moltes de les seves reivindicacions foren admeses al congrés de Querétaro (1917), però morí en una presó nord-americana pel fet d’haver redactat un manifest adreçat a tots els revolucionaris del món.