Membre d’una família d’editors de música i de violinistes, es tenen poques dades sobre la seva trajectòria. Treballà juntament amb el seu germà Jean-Pantaléon. Cap al 1759 la seva editorial fou comprada per la casa La Chevardière, però és possible trobar partitures amb el nom Le Clerc en anys posteriors. De vegades, unit al nom Le Clerc apareix el de François Boivin, però no hi ha proves documentals que es tractés del seu soci. Sembla que els dos germans foren violinistes al servei del rei Lluís XV. Charles-Nicolas, concretament, ocupà aquest càrrec fins el 1761. Editaren obres de famosos compositors flamencs, italians i alemanys. Les publicacions conservades de Le Clerc són bàsicament de música instrumental i escènica. El seu germà, a més, era compositor. De Jean, n’ha pervingut el recull titulat Contredanses, que ell mateix publicà entre el 1730 i el 1745.