Organista a l’església de Santa Sofia de Dresden el 1733, l’any següent es posà al servei del príncep Frederic -posteriorment Frederic el Gran- i el 1740 fou clavicembalista a la capella de la cort de Berlín. Com a compositor, només es dedicà a la música instrumental i escriví un gran nombre d’obres de cambra i orquestrals. La seva aportació més interessant és la música per a teclat, amb diverses col·leccions de sonates publicades en vida seva. Els seus concerts mostren la influència dels mètodes formals d’A. Vivaldi. La música de Schaffrath pertany a un període de transició en què ja s’aprecien característiques de l’estil galant. Algunes de les seves obres revelen la influència de C.P.E. Bach pel que fa a l’exposició temàtica i a les troballes harmòniques.