Format inicialment a la catedral de València, on consta que el 1623 era escolà de cant de la capella de música. Posseïa una bona veu de contralt, raó per la qual obtingué diversos càrrecs: cantor i tinent de mestre de capella a la catedral de Terol al març del 1628; mestre amb obligació de cantar a la catedral d’Albarrasí al maig del 1628, i el mateix càrrec a la seu de Sogorb. Al setembre del 1634 obtingué una capellania de cant a la catedral de València, el capítol catedralici de la qual li encomanà la cura dels escolans i, a l’octubre del 1644, fou nomenat mestre de capella (com a successor de Joan B. Comes). No es coneix la data de la seva mort, però el càrrec que ocupava a la seu de València fou ocupat al setembre del 1650 per Diego Pontac; des d’aquesta ocasió no es conserva cap més notícia documentada de Francesc Navarro. De la seva obra compositiva s’han conservat una vintena llarga d’obres, la major part de les quals són litúrgiques.