Estudià amb el seu pare, José Santos Gómez, i posteriorment amb M. Corral, M. Gonesta i M. Izquierdo. Començà la seva activitat professional com a professor substitut i director d’òpera. Més tard fou nomenat mestre de capella de la catedral de Mèxic. Allà formà el cor i compongué molta música litúrgica per a cant i per a orgue. De la seva música profana, l’exemple més conegut és Variaciones sobre el tema del jarabe, per a piano, un dels primers antecedents del nacionalisme musical mexicà. El 1939 fundà una societat filharmònica que agrupava un conservatori i una editorial i on, tot i ser un fracàs financer, es formaren importants músics mexicans. Morí en la misèria.